MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid1

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015319	T	7	7	50	56	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015319	T	6	6	87	92	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015319	ACA	2	6	107	112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015319	TCT	2	6	143	148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015319	AATT	2	8	151	158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015319	A	6	6	170	175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015319	A	7	7	205	211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015319	TAA	2	6	216	221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015319	TCA	2	6	251	256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015319	TTA	2	6	260	265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015319	A	6	6	265	270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015319	AAT	2	6	274	279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015319	TAT	2	6	339	344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015319	ATA	2	6	2001	2006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015319	CCT	2	6	2341	2346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015319	ATT	2	6	2354	2359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015319	TCA	2	6	2533	2538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015319	T	6	6	2547	2552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015319	TCTA	2	8	2564	2571	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015319	AAT	2	6	2606	2611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015319	TAT	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015319	GTG	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015319	ATT	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015319	AAC	2	6	2713	2718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015319	CTTAA	2	10	3611	3620	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015319	T	6	6	3645	3650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015319	ATTT	2	8	3656	3663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015319	AT	3	6	3686	3691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015319	AT	3	6	3710	3715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015319	TATT	2	8	3731	3738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015319	TAT	2	6	3800	3805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015319	GCT	2	6	3844	3849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015319	TAAA	2	8	3852	3859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015319	AGG	2	6	3879	3884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015319	A	7	7	5281	5287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015319	T	7	7	5317	5323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015319	ATA	2	6	5373	5378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015319	CTTT	2	8	5578	5585	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015319	TCC	2	6	6105	6110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015319	CTT	2	6	6150	6155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015319	TCT	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015319	AT	3	6	6981	6986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015319	AAT	2	6	7010	7015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015319	GCT	2	6	7016	7021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015319	TAC	2	6	7033	7038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015319	A	6	6	7053	7058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015319	ATT	2	6	7189	7194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015319	A	6	6	7255	7260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015319	A	6	6	7280	7285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015319	A	6	6	7340	7345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015319	GTT	2	6	7400	7405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015319	ATTA	2	8	7429	7436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015319	CTT	2	6	7901	7906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015319	TAA	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015319	AG	3	6	7975	7980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015319	A	7	7	8000	8006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015319	ACA	2	6	8166	8171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015319	TGTT	2	8	8191	8198	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015319	TTTA	2	8	8243	8250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015319	TG	3	6	8280	8285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015319	TAT	2	6	8291	8296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015319	TCAT	2	8	8306	8313	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015319	GTA	2	6	8347	8352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015319	A	6	6	8382	8387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015319	A	7	7	8409	8415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015319	TAC	2	6	8420	8425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015319	T	7	7	9290	9296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015319	AC	3	6	9344	9349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015319	TTC	2	6	9363	9368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015319	AAT	2	6	9411	9416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015319	T	7	7	9416	9422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015319	C	6	6	9470	9475	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_015319	ATT	2	6	9505	9510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015319	CAA	2	6	9517	9522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015319	CTAA	2	8	9545	9552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015319	T	6	6	9604	9609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015319	TTC	2	6	9619	9624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015319	T	6	6	9632	9637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015319	TGA	2	6	9729	9734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015319	CAT	2	6	9769	9774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015319	TAAA	2	8	9795	9802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015319	A	6	6	9800	9805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015319	TTCA	2	8	9828	9835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015319	AAT	2	6	9837	9842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015319	CAT	2	6	9871	9876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015319	GAA	2	6	9945	9950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015319	TATT	2	8	9970	9977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015319	AATA	2	8	9985	9992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015319	ATT	3	9	9999	10007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015319	ATT	2	6	10049	10054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015319	TAGT	2	8	10070	10077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015319	ACTTTT	2	12	10079	10090	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015319	T	7	7	10087	10093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015319	ACTTTT	2	12	10118	10129	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015319	T	7	7	10126	10132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015319	ACTTTT	2	12	10157	10168	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015319	T	7	7	10165	10171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015319	TAA	2	6	10184	10189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015319	ACTTTT	2	12	10196	10207	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015319	T	8	8	10204	10211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015319	ATC	2	6	10241	10246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015319	ATA	2	6	10253	10258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015319	A	7	7	10326	10332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015319	A	7	7	10349	10355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015319	TAA	2	6	10368	10373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015319	TTTTA	2	10	10454	10463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015319	TC	3	6	10496	10501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015319	CTT	2	6	10831	10836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015319	TTTAT	2	10	10871	10880	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015319	CCT	2	6	11398	11403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015319	TA	3	6	11412	11417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015319	TTAA	2	8	11451	11458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015319	ATA	2	6	11485	11490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015319	TTA	2	6	11507	11512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015319	GTG	2	6	11552	11557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015319	GTT	2	6	11648	11653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015319	ATTA	2	8	11712	11719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015319	T	6	6	12386	12391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015319	TCATTA	2	12	13713	13724	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_015319	ATT	2	6	13792	13797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015319	CTTA	2	8	15179	15186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015319	TAAA	2	8	15197	15204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015319	ATC	2	6	15206	15211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015319	TAATT	2	10	15220	15229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015319	CCA	2	6	16504	16509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015319	AAAAT	2	10	16607	16616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015319	T	6	6	16686	16691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015319	TCA	2	6	16809	16814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015319	CCA	2	6	16863	16868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015319	GTG	2	6	17028	17033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015319	TTAC	2	8	17918	17925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015319	AGTCT	2	10	17932	17941	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015319	T	6	6	17950	17955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015319	CAC	2	6	17979	17984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_015319	CT	3	6	18301	18306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015319	T	7	7	18312	18318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015319	TAT	2	6	19134	19139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015319	ATGCA	2	10	19181	19190	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015319	TTA	2	6	19280	19285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015319	TAT	2	6	19307	19312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015319	ATT	2	6	19487	19492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015319	CTG	2	6	19501	19506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015319	T	7	7	19529	19535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015319	ATCA	2	8	19544	19551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015319	A	7	7	19582	19588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015319	TAT	2	6	19612	19617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015319	ATA	2	6	19640	19645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015319	TA	3	6	19653	19658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015319	TTCC	2	8	19695	19702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015319	TA	3	6	19714	19719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015319	CAA	2	6	19728	19733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015319	A	6	6	19732	19737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015319	ATT	2	6	19797	19802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015319	GGC	2	6	20245	20250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015319	TCA	2	6	20292	20297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_015319	TA	3	6	20301	20306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015319	ATG	2	6	20318	20323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015319	CTG	2	6	20360	20365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_015319	AT	3	6	20462	20467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015319	T	6	6	20488	20493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015319	T	6	6	20497	20502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015319	CAT	2	6	20504	20509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_015319	GA	3	6	20550	20555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015319	ATG	2	6	20618	20623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015319	ACTAC	2	10	20629	20638	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
166	NC_015319	A	6	6	20726	20731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015319	T	6	6	20799	20804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015319	CTT	2	6	21469	21474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_015319	ATT	2	6	21492	21497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015319	TTA	2	6	21514	21519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015319	AGA	2	6	21677	21682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015319	CCT	2	6	21686	21691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_015319	TTTAAT	2	12	21744	21755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_015319	TAT	2	6	21758	21763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015319	CAA	2	6	21866	21871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_015319	A	7	7	21870	21876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_015319	GAG	2	6	21914	21919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
178	NC_015319	AC	3	6	21932	21937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
179	NC_015319	AAC	2	6	21939	21944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_015319	ACTA	2	8	21991	21998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
181	NC_015319	A	6	6	22092	22097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015319	AG	3	6	22126	22131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
183	NC_015319	T	6	6	22140	22145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015319	GTC	2	6	22164	22169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_015319	ATT	2	6	22737	22742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015319	TTAATT	2	12	22776	22787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_015319	A	6	6	23848	23853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015319	TAT	2	6	23940	23945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_015319	ATA	2	6	23970	23975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015319	TAT	2	6	23976	23981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_015319	TACAT	2	10	24066	24075	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
192	NC_015319	TACT	2	8	24133	24140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
193	NC_015319	TAATT	2	10	24147	24156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_015319	T	6	6	24214	24219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_015319	AT	3	6	24237	24242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_015319	T	6	6	24242	24247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_015319	GAT	2	6	24248	24253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
198	NC_015319	AT	3	6	24273	24278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_015319	ATTT	2	8	24289	24296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_015319	AT	3	6	24306	24311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_015319	TA	4	8	24325	24332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_015319	T	6	6	24449	24454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_015319	TAA	2	6	24511	24516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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206	NC_015319	TAC	2	6	24683	24688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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230	NC_015319	TTTCTC	2	12	33582	33593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.